Ο οικισμός των Μύλων είναι κτισμένος αμφιθεατρικά στις κλιτύες του ομώνυμου φαραγγιού σε απόσταση περίπου 2 χλμ. από το Χρωμοναστήρι. Το όνομά του ο οικισμός το πήρε από τους νερόμυλους που υπήρχαν εκεί. Το 1970 ο οικισμός εγκαταλείφθηκε και δημιουργήθηκε νέος έξω από το φαράγγι, κατά μήκος της δυτικής του πλευράς. Ο εγκαταλειμμένος οικισμός είναι εν μέρει ερειπωμένος, αλλά ιδιαίτερης αισθητικής αξίας, χωρίς σημαντικές αλλοιώσεις. Το φαράγγι είναι κατάφυτο και οι ημιεγκαταλειμμένοι οπωρώνες και ελαιώνες έχουν κατακλησθεί από άγρια βλάστηση. Στο ανώτερο τμήμα της απόκρυμνης ανατολικής κλιτύος υπάρχουν σπηλιές που χρησίμευαν για μαντριά. Το μονοπάτι προς τη θάλασσα είναι ιδιαίτερης αισθητικής αξίας.

Το 1970 εγκαταλείφθηκε ο οικισμός των Μύλων λόγω του κινδύνου κατολισθήσεων.

Από τους Μύλους προς Ρέθυμνο.

Το φαράγγι των Μύλων σε μικρή απόσταση από το Ρέθυμνο, είναι από τα ωραιότερα τοπία της Δυτικής Κρήτης. Η εγκατάλειψη του οικισμού το διέσωσε από τις επεμβάσεις που αλλοιώνουν όλους ανεξαιρέτως τους οικισμούς στη Κρήτη.

Η πρώτη ταβέρνα που έχει δημιουργηθεί προκαλεί ηχορρύπανση. Στους χώρους πικ-νικ που έχει δημιουργήσει το Δασαρχείο συσσωρεύονται τα σκουπίδια.