Το Χρωμοναστήρι είναι ένα παραδοσιακό χωριό, κτισμένο στο πλάτωμα της κορυφής ενός πρόβουνου του Βρύσινα που υψώνεται πάνω στον κάμπο των Περιβολιών και περιβάλλεται Ανατολικά και Δυτικά από φαράγγια. Η περιοχή γύρω από το Χρωμοναστήρι καλύπτεται από ελαιώνες και πυκνή μακία με διάσπαρτες βελανιδιές και κυπαρίσια. Το τοπίο είναι τραυματισμένο από τη διάνοιξη δρόμων και τις εκχερσώσεις. Ο παραδοσιακός οικισμός έχει αλλοιωθεί από νέα ακαλαίσθητα κτίσματα.

Ενετικό χωριό με βίλα και βυζαντινές εκκλησίες (Κατάγραφος ναός του Αγ. Ευτυχίου με τις παλαιότερες τοιχογραφίες της Κρήτης (11ος αιώνας).

Πανοραμική θέα από την Παναγία Κερά στους πρόποδες του Βρύσινα πάνω από το Χρωμοναστήρι προς το χωριό και τη θάλασσα.

Η κύρια αλλοίωση των τοπίων είναι η οδοποιία και οι εκχερσώσεις. Ο παραδοσιακός οικισμός κινδυνεύει από ακαλαίσθητα κτίρια και τη δόμηση γύρω από το χωριό.